“浮肥”现象最重要的因素取决于肥料本身的性质，当肥料颗粒的表观容重小于水层的比重时，肥料就会浮上来，相反就沉下去。而肥料颗粒表观比重的大小又取决于造粒加工时原料、填充料的种类和质量，以及内部孔隙等诸多因素。例如使用磷酸一铵做生产复合肥的原料，肥料比重就会偏轻；高岭土等填充料多一些，比重就会增加；肥料氮磷钾成分中，含氮多就较轻，含硝酸多，形成孔洞就会使颗粒变轻。
防结块剂厂家在肥料水溶的过程中，认为其养分已基本溶进水里，上浮部分是肥料在吸收水分、汽化过程中产生膨胀，因其比重小于水才浮起来，时间久了还会沉淀下去，而且这些上浮物主要是肥料的填充料，不属于养料成分。
目前“浮肥”现象多以包衣肥料为主，当肥料养分被水充分溶解后，肥料自身会留有一个空壳，由于空壳质量较轻，漂浮在水面上属于正常现象。为防止肥料结块，生产企业在肥料包装之前往往在肥料颗粒表面喷涂一定量的防结块剂，防结块剂的成分多为有机高分子物质，施于水田后短期内产生疏水性，导致肥料颗粒漂浮。
长期以来的施肥习惯，许多农民习惯直接将肥料抛撒在水田中，再用耙子在水田耧一下，这样肥料并没有深入土壤，当肥料比重较轻时，也很容易出现漂浮现象。水质、气温等外部环境也是造成漂浮的重要原因。例如田里的水盐分含量高、施肥多、溶液比重就增加，漂浮力也就会增大。在低温环境中，肥料往往不容易快速溶化分解，也可能产生“浮肥”现象。